Chemik z Gdańska będzie prowadził badania na Cambridge
Dr Krzysztof Kamil Bojarski
Dr Krzysztof Kamil Bojarski będzie prowadził badania na Uniwersytecie w Cambridge razem z grupą prof. Davida Walesa, znaną z przełomowych badań w dziedzinie chemii obliczeniowej. Praca chemika z PG może przyczynić się do rozwoju nowych terapii nowotworów czy takich chorób jak reumatoidalne zapalenie stawów.
Dwa lata badań
Badania na Uniwersytecie w Cambridge będą dotyczyły relacji enzymów (katepsyny) i cukrów złożonych (glikozaminglikany).
Rozpoczną się w październiku tego roku i potrwają dwa lata. Chemik z gdańskiej uczelni będzie pracował z zespołem prof. Davida Walesa. Wykorzystane zostaną zaawansowane metody modelowania molekularnego oraz innowacyjne narzędzia obliczeniowe opracowane przez naukowców z Cambridge.
- Dzięki wykorzystaniu tych zaawansowanych narzędzi będzie możliwe uzyskanie wysokiej dokładności obliczeń przy niskich kosztach obliczeniowych (czasu i mocy obliczeniowej), umożliwiając dokładny opis mechanizmów reakcji enzymatycznych katepsyn w obecności i przy braku glikozaminoglikanów - mówi dr Bojarski, stypendysta NAW-y.
Efektem tej współpracy ma być opracowanie nowatorskiej metodologii pozwalającej na określenie wpływu wiązania glikozaminoglikanu na kinetykę aktywności enzymatycznej katepsyn.
Naukowiec z PG w europejskiej sieci doskonałości w dziedzinie AI
Nowe terapie
Badania naukowców mogą stworzyć nowe możliwości terapeutyczne.
- Katepsyny, będące enzymami (proteazami), odpowiadają za rozkład m.in. kolagenu i innych ważnych biochemicznie substancji. Ich zaburzona aktywność prowadzi do zaburzenia funkcjonowania organizmu. Na przykład destabilizacja aktywności katepsyny K przyczynia się do rozwoju osteoporozy. Natomiast glikozaminglikany to polisacharydy, czyli złożone cukry, a jedną z ich ról jest kontrola aktywności enzymatycznej katepsyn, ale również i innych enzymów - mówi dr Bojarski. - Katepsyny są bowiem kluczowe dla degradacji białek, a ich dysfunkcja jest związana z wieloma chorobami, takimi jak nowotwory, reumatoidalne zapalenie stawów czy zaburzenia neurodegeneracyjne - dodaje.
Katalog.trojmiasto.pl – Myślisz o studiach - zobacz, jakie kierunki wybrać: Szkoły wyższe w Trójmieście
Z Gdańska na Harvard. 17 naukowców ukończyło studia podyplomowe na prestiżowej uczelni
Grupa badawcza na Wydziale Chemicznym PG
Dr Krzysztof Bojarski pracuje w zespole naukowców kierowanym przez prof. Jacka Czuba, który na Wydziale Chemicznym PG zajmuje się komputerową biofizyką molekularną. Ich badania koncentrują się na molekularnych mechanizmach i siłach napędowych procesów o znaczeniu biologicznym. Do rozwiązywania problemów badawczych naukowcy wykorzystują symulacje oparte na modelach molekularnych, a także multidyscyplinarną wiedzę z pogranicza chemii, fizyki, biologii i informatyki. Dr Bojarski jest liderem podgrupy zajmującej się cukrami.